五色萬代錦很少會遇到害蟲，偶爾會有介殼蟲，往往是其他植物生的。對付這種害蟲，普通的農藥很難將其消滅，因為它有一層特殊的外殼可以避免觸殺農藥生效，只能人工摘除。另外，要注意環境通風，這樣也可以預防其他蟲害。
