甘蔗病毒病會在葉片上產生許多不規則的淡綠色或淡黃色的與葉脈平行的短條紋，蚜蟲是最主要的病毒傳播者，農事操作所造成的機械摩擦和斬過病蔗的蔗刀也會傳毒。可以通過鹽酸嗎啉胍乙酸銅、香菇多糖、菇類蛋白多糖、病毒A、病毒K、蕓薹素內酯等來控制病毒。
甘蔗可以選用抗病優良品種，建立健康種苗繁育基地，選用無病種苗。控制蚜蟲，減少傳播蟲媒，砍蔗種前先砍掉有病植株再留種，減少傳染源。
